两者的意思是不一样的，可以通过词语的意思来进行辨析，具体如下：
1、咫尺天涯基本意思是比喻距离虽近但很难相见，像在很远的天边一样。天涯咫尺是一个汉语成语，比喻距离虽远，但心心相通，像是近在眼前一样。咫，尺 是长度单位 ，天涯意指天边即很远的地方。
2、咫尺天涯和咫尺天涯的字的顺序是不一样的。
天涯咫尺意思是距离虽远，但心意相通，像是在眼前一样。咫尺天涯刚好相反，距离虽近但很难相见，象是远在天边一样。
“咫尺天涯”——强调两地的人相距很近，但却如相隔天涯那样远；这是人与之间的心不同时的感觉。“天涯咫尺”——强调两地的人相距很远，但却如相隔咫尺那样近。这是人与之间的心相同时的感觉。
天涯咫尺指相距虽近，却无缘相见，就像在遥远的天边一样。《群音类选．诸腔类．卷四．访友记又赛槐阴分别》：「衷肠事，无由竭，似水滔滔，相流不绝，对面还愁，天涯咫尺。」也作「咫尺天涯」、「咫尺千里」。
